Снижение объемов перевалки произошло практически по всем видам грузов. В частности, перевалка рыбопродукции сократилась на 34,8% - до 55,8 тыс. тонн, минеральных удобрений в таре - на 41,5%, до 150 тыс. тонн, щебня - в 12 раз, до 11 тыс. тонн. Перевалка контейнеров снизилась на 47,5% - до 92 тыс. тонн.
Калининградский морской рыбный порт является базовым для рыбопромослового флота на Северо-Западе России. К порту приписаны около 200 судов. В 2008 году КМРП перевалил 3,144 млн тонн грузов.