Объем перевалки экспортных грузов увеличился по сравнению с прошлым годом на 4,6% (85,7 млн тонн), в том числе: угля - на 3% (12,8 млн тонн), зерна - в 7 раз (4,4 млн тонн), руды - почти в 3 раза (1,2 млн тонн), а также наливных грузов - на 6,3% (53,6 млн тонн). Вместе с тем, почти в 2 раза сократилась перевалка минеральных удобрений и лесных грузов, черных металлов на 9,5%, грузов в контейнерах на 23,5%.
Перевалка импортных грузов сократилась на 40% - до 5,7 млн тонн в том числе, грузов в контейнерах - на 44%, рефрижераторных - на 34,6%.
Объем перевозок транзитных грузов через морские порты России вырос на 18,6% (11,3 млн тонн) за счет сырой нефти, в то же время перевалка сухих грузов сократилась на 41,5%.
В каботаже перевалка грузов увеличилась в 1,6 раза: сухих - на 6,8%, наливных – в 2,1 раза.
В I квартале 2009 году произошло существенное снижение объемов грузопереработки в отдельных морских портах, что является прямым следствием мирового экономического кризиса. Так, за I квартал 2009 году грузооборот ОАО «Калининградский морской торговый порт» снизился на 46%, ОАО «МП Санкт-Петербург» на 19%, ОАО «Владивостокский морской торговый порт» на 26%.