Ректором нового укрупненного учебного заведения назначен Владимир Волкогон, возглавлявший до недавнего времени академию.
Приказ о реорганизации калининградских высших учебных заведений был подписан 25 января 2012 года главой Федерального агентства по рыболовству Андреем Крайним.
Ранее на правительственном уровне было принято решение о сокращении количества высших учебных заведений. За последние 2 года году были объединены десятки вузов. Министр образования заявил, что через несколько лет Россия должны прийти к тому, что в стране будет не более 150 университетов.