Следствием установлено, что 22 июля 2011 года сухогруз «Варнек» вышел из порта Архангельск без сопровождения страхующего судна и разрешения капитана порта, попал в сильный шторм и затонул в районе мыса Канин Нос. Согласно заключению комиссии Федеральной службы по надзору в сфере транспорта, судно опрокинулось в результате потери управляемости и остойчивости 24 июля 2010 года.
Экипаж составлял 5 человек. Судно перевозило 17 контейнеров с различным грузом, железобетонные блоки и стройматериалы. При прохождении пограничного портового контроля капитан судна сообщил на КПП «Архангельск» только о грузе и экипаже. И от судовладельца, и от пограничников было сокрыто присутствие на борту судна 4 пассажиров (среди них - годовалый ребенок), следовавших за денежное вознаграждение до портопункта Индига, расположенного в Чешской Губе Баренцева моря. Подобная практика существовала и ранее. Лицензии на перевозку пассажиров не имелось. В нарушение Регистра морского судоходства по району плавания для данного судна (удаление не далее 50 миль от ближайшего места-убежища) о конечном пункте следования не было сообщено в Инспекцию государственного портового контроля в порту города Архангельска.
Об отсутствии связи с судном генеральный директор ООО «Норд-Вей» поставил в известность ФГУ «Администрация морского порта Архангельск», управление МЧС по Архангельской области и другие службы спасения. В результате поисковой операции 26 июля 2010 года «Варнек» был обнаружено вертолетом МЧС на береговой линии в перевернутом состоянии, нос судна на суше, кормовая часть - в воде. Спасшихся пассажиров на берегу и на судне не было. На берегу найден один спасательный термогидрокостюм.
Спустя 2 дня, 28 июля, вблизи места аварии на прибрежной береговой линии в 1,5 км от места крушения обнаружено тело одного пассажира. Тел 5 членов экипажа и 3 пассажиров не найдено, в том числе при производстве неоднократных водолазных осмотров с разрезанием конструкций и переборок. После обследования помещений судна было принято решение о его буксировке в порт Архангельск. При буксировке сухогруз «Варнек» 5 августа 2010 года затонул из-за резкого ухудшения погоды около мыса Керец на глубине около 20 м.