Благовещенск - одна из ключевых станций Забайкальской железной дороги, через которую проходит большая часть экспортных грузов из Амурской области (соя, соевое масло, уголь, минеральные удобрения). Кроме того, в 140 км от Благовещенска находится Свободненский вагоноремонтный завод - одно из предприятий, где ремонтируются вагоны ОАО «ПГК».
ПГК работает с крупнейшими производителями Амурской области. Среди них - компания «Русский уголь» (предприятие объединяет 6 угольных разрезов, 8 шахт, 3 обогатительные фабрики), для которой ПГК ежемесячно производит выгрузку около 1800 вагонов угля на станции Екатеринославка. С ООО «Амурагроцентр» - предприятием, перерабатывающем зерновые и бобовые культуры на Дальнем Востоке России, у ПГК также налажено тесное взаимодействие.
Территориальное подразделение ПГК в Благовещенске - не единственное в Амурской области. С 2009 года функционирует представительство в городе Белогорск. Всего в структуре Иркутского филиала ОАО «ПГК» - 15 территориально-обособленных подразделений на Забайкальской и Восточно-Сибирской железных дорогах.