Деятельность таможенного поста Выборгский Санкт-Петербургской таможни была временно приостановлена с конца февраля 2010 г. в связи с задержанием при проведении оперативных действий сотрудниками Главного управления по борьбе с контрабандой (ГУБК) ФТС России 22 автотранспортных средств с товарами, прибывшими для таможенного оформления на Выборгский таможенный пост Санкт-Петербургской таможни.
При этом фактический вес задержанных партий товара общей стоимостью более 300 млн рублей существенно превысил заявленный. В ходе проверки возбуждено уголовное дело по ст. 188 УК РФ (контрабанда).
Таможенное оформление в регионе осуществляется на таможенном посту Шушарский Санкт-Петербургской таможни (включая Курортный и Приморский районы города Санкт-Петербурга). В регион деятельности таможенного поста Южный Санкт-Петербургской таможни включены Адмиралтейский, Василеостровский, Петроградский и Центральный районы города Санкт-Петербурга, муниципальные образования Выборгского района Санкт-Петербурга: поселок Парголово, муниципальные образования – муниципального округа Сампсониевское, Светлановское, Сосновское, Парнас. Таможенное оформление также будет усилено за счет планируемого открытия дополнительных отделов таможенного оформления на Южном таможенном посту Санкт-Петербургской таможни.
В полном объеме работают все таможенные посты Балтийской таможни. На днях издан приказ СЗТУ о начале реализации проекта «сухой порт».