В соответствии с действующей редакцией Соглашения, имущество железнодорожного транспорта, входящее в состав железных дорог одного государства, но расположенное на территории другого государства, передано в управление страны нахождения данного имущества. Ратификация протокола позволит передать и получить участки железных дорог в собственность стороне, осуществляющей их эксплуатацию. Таким образом, Казахстану будут переданы участки общей протяженностью 575 км, России - 566,4 км.
В соответствии с документом, таможенное оформление, таможенный и пограничный контроль перемещения товаров и транспортных средств, необходимых для обслуживания инфраструктуры этих железнодорожных участков, осуществляется в упрощенном режиме. Также не будут взиматься пошлины и налоги.
Протокол был подписан 21 мая 2009 года в Астане.
В материалах Госдумы говорится, что необходимость внесения изменений в Соглашение связана, в первую очередь, с проведением структурных реформ на железнодорожном транспорте двух государств.