Экологическая станция установлена у причала на острове Белый в Большом порту Санкт-Петербург. Договор об аренде причала сроком на 5 лет между ГУП «Водоканал» и ЗАО «Портовый флот» подписан в начале 2008 года. Арендатор вложил около 5 млн руб. в реконструкцию причала: на причал проведен водопровод, создана канализационная система и проведено электричество.
Строительство судна велось 4 года по собственному проекту ЗАО «Портовый флот». Корпус плавучей очистной станции класса «Р» «Экомарин -3» построен по заказу ЗАО «Портовый флот» на ОАО «Ахтубинский судостроительный завод» (Астраханская область). Технологическая оснастка судна осуществлена ООО «Эридан» (Санкт-Петербург). На судне установлено оборудование для очистки льяльных и нефтесодержащих вод по оригинальной, разработанной ЗАО «Портовый флот» технологии, которая не имеет аналогов в России.
Ввод станции в эксплуатацию позволит в 3 раза увеличить возможность очистки нефтесодержащих вод в Большом порту Санкт-Петербург по сравнению с сегодняшним днем, и снять напряжение пиковых нагрузок в моменты наиболее массового захода судов в порты российской части Финского залива.
Компания ЗАО «Портовый флот» основана в 1997 году. Компания оперирует флотом из 39 судов различного назначения и способна выполнять любые задачи по комплексному обслуживанию судов как на акватории порта Санкт-Петербург так и за ее пределами. ЗАО «Портовый флот» имеет договор с ФГУП «Росморпорт» на оказание услуг судам, оплачивающим в установленном порядке экологический сбор и находящимся на акватории Большого порта Санкт-Петербург, по приему и обезвреживанию (размещению) судовых отходов.