В наблюдательный совет ВМТП вошли: президент ООО «Транспортная группа FESCO» Сергей Генералов, член правления, вице-президент по финансам ООО «Транспортная группа FESCO» Юрий Гильц, председатель совета директоров ЗАО «Камчатские линии» Александр Домнин, директор ЗАО МАК «Трансфес» Дмитрий Курдаков, руководитель направления терминального развития по Дальневосточному региону ОАО «Управляющая компания транспортная группа FESCO» филиал во Владивостоке Алексей Михайлов, генеральный директор ОАО «Владивостокский морской торговый порт» Вячеслав Перцев, почетный президент ОАО «Владивостокский морской торговый порт» Михаил Робканов, заместитель генерального директора по корпоративному развитию ЗАО «Транспортная инвестиционная компания» Вячеслав Смирнов, вице-президент по портовому дивизиону ООО «Транспортная группа FESCO» Андрей Токарев, генеральный директор ООО «ТФМ ТЭКО МАРИТАЙМ» Виталий Фомичев, вице-президент по правовым вопросам ООО «Транспортная группа FESCO» Дмитрий Шохин, генеральный директор ЗАО «Менеджмент-Стандарт» Василий Яковенко.
Председателем Наблюдательного совета ОАО «ВМТП» был избран Сергей Генералов, заместителем председателя Михаил Робканов.
Аудитором общества на 2009 год утверждено ООО «Моор Стивенс».