Постоянно действующим органом управления подсистемы на федеральном уровне является ФГБУ «Морспасслужба»
На Федеральном портале для размещения проектов нормативно-правовых актов опубликован проект Положения о функциональной подсистеме организации и координации деятельности поисковых и аварийно-спасательных служб (как российских, так и иностранных) при поиске и спасании людей и судов, терпящих бедствие на море в поисково-спасательных районах Российской Федерации единой государственной системы предупреждения к ликвидации чрезвычайных ситуаций.
В соответствии с проектом документа, постоянно действующим органом управления функциональной подсистемы являются на федеральном уровне — Федеральное государственное бюджетное учреждение «Морская спасательная служба» (ФГБУ «Морспасслужба»); на региональном уровне — Администрации морских портов.
С принятием нового Положения планируется признать утратившим силу приказ министерства транспорта Российской Федерации от 26 ноября 2007 г. № 169.