В связи с активным льдообразованием в Тауйской губе и в бухте Нагаева, на основании долгосрочного прогноза ледовых условий в Охотском море, в морском порту Магадан и на подходах к нему с 24 декабря 2018 года установлены ограничения для судов по режиму ледового плавания в период ледокольных проводок 2018-2019 годов. Соответствующее распоряжение подписал капитан порта Романоз Цхадаия.
Согласно распоряжению, к плаванию во льдах не допускаются: буксирно-баржевые составы, суда с неисправной судовой энергетической установкой или винто-рулевым устройством, суда, не имеющие ледовых усилений, суда с категорией ледовых усилений Ice2.
К плаванию во льдах допускаются: суда с категорией ледовых усилений Ice3 и выше.
Магаданский морской порт является крупнейшим на северо-востоке России. Морской порт принимает суда под обработку длиной до 200 м осадкой до 11 м. Период навигации в порту- круглогодичный. В период ледообразования (декабрь-май) в порту и на подходах к нему осуществляется ледокольная проводка судов.
В настоящее время через морской порт осуществляется основная транспортная связь Магадана и центральных районов Магаданской области с морскими портами Дальнего Востока и соседних государств Тихоокеанского региона. Морской порт Магадан расположен на стыке двух транспортных магистралей-морского транспортного пути и Колымской трассы протяженностью 2021 км.
В порту имеется 13 причалов, из которых три для нефтепродуктов, два для контейнеров, и восемь для других грузов.
Грузооборот морского порта Магадан в 2017 году составил 1,4 млн тонн.