В 2006 году 117 грузовыми судами Северо-Западного пароходства перевезено 5 850 тыс. тонн грузов, из них 4 585,4 тыс. тонн – в загрансообщении. Как сообщает отдел рекламы и PR Северо-Западного пароходства, в сравнении с 7 763,4 тыс. тонн, перевезенными в 2005 году 143 судами, отмечается некоторое снижение объёма перевозок. Перевозки грузов по внутренним водным путям России в целом сохранились на уровне 2005 года. Вырос на 114,5 тыс. тонн объём перевозок строительных грузов, на 17,5 тыс. тонн – плодоовощных.
В связи с переключением части внутреннего флота на более эффективные перевозки, в частности, доставки щебня из Карелии и Ленинградской области в Москву и порты Волжского бассейна, уменьшились объемы по отдельным видам грузов, в числе которых удобрения и лесные грузы. Сокращение объёмов лесных грузов объясняется еще и заменой их более выгодными перевозками пиломатериалов из Подпорожья в порты Западной Европы. Положительным фактором навигации 2006 года стало увеличение доли готовой продукции в общем объёме перевозок, наряду с ростом объёма перевозок импортных грузов по отношению к экспортным доставкам сырья из России в Европу.
Производительность работы флота «река-море» увеличилась на 3,5 %, доходы на одно судно – на 6,4 %. Возросла эффективность эксплуатации буксирно-вспомогательного флота. По этой группе флота доходы на одно судно в среднем составили 128 578 USD, что на 70% выше запланированного. В декабре 2006 года введен в эксплуатацию теплоход класса «река-море» «Русич-10». Все дочерние предприятия пароходства работали с полной загрузкой. В 2006 году введены в эксплуатацию следующие объекты: на Вознесенской РЭБ флота – цех деревообработки; в Пассажирском порту – причалы пассажирского флота и офисное здание; на верфи «Речная» – новые слиповые сооружения; в Снабсервисе – новые складские помещения повышенного класса.
На Невском ССЗ полностью восстановлена надводная часть слипа, начались работы по реконструкции 1 и 2 пролетов эллинга, создания мощностей по формированию стапеля и цеха сборки блоков и корпусов судов. В 2006 году завод выполнил 2 контракта для голландской фирмы DAMEN SHIPYARDS по строительству 12-ти буксиров Multi Cat проектов 1506 и 1908.
ОАО «Пассажирский порт» подписал соглашение с транспортным комитетом правительства Санкт-Петербурга об увеличении компенсации на содержание паромной линии Ломоносов-Кронштадт с 50 до 100% по прямым затратам. Всего на линии Ломоносов-Кронштадт в навигацию 2006 года было перевезено 291,8 тыс. пассажиров. Услугами экскурсионно-прогулочного флота Пассажирского порта воспользовались 370,1 тыс. человек. За прошедшую навигацию портом принято на обслуживание 38 круизных судов на причалах Речного вокзала, 26 – в Уткиной заводи, 26 – на Соляном причале, 39 – на Валааме. Всего на причалы, обслуживаемые Пассажирским портом в Санкт- Петербурге, круизными судами различных компаний было совершено 820 судозаходов, из них 337 – на Речной вокзал и 340 – в Уткину заводь.
Некоторые дочерние предприятия завершили 2006 год с прибылью. Ожидаемая прибыль ООО «Снабсервис» может составить 8,3 млн. руб., ООО «Волга-Нева» 3,7 млн. руб., ОАО «Белозерский порт» – 1,8 млн. руб., ООО «Верфь «Речная» – 2 млн. руб.